从开普敦到金河湾的航程总体上说比较顺利，没遇到什么极端天气和海况，不过有一件事儿让贾宝玉出了一身冷汗，传染病！有可能是痢疾，也有可能是霍乱，反正就是上吐下泻。这种情况最先是从黄崖船上发生的，这个家伙胆大包天，居然没第一时间向贾宝玉汇报，结果连续出现了十多个病患时，他才慌了神，不得不通知了旗舰。
传染病最终还是控制住了，但贾宝玉使用的手段非常残忍。他把所有病患全关进了马六甲号的底舱，严格消毒和隔离，除了派专人给他们送饭之外，所有人都不许和他们接触。而且马六甲号上的所有淡水、食品全都被扔进了海里，两艘船上四百多人就靠金河号的给养过日子，连海鲜都不许捕捞了.
在付出了二十三名水手的生命之后，疫情慢慢的减少并消失，然后马六甲号的底舱五间舱房就成了禁地，任何人不许进出，全封闭！病情好转的三十多名水手全被隔离到了另外的舱室，还是不许和别人接触。
当马六甲号彻底没有新的病号出现时，船队已经驶过了巽他海峡。贾宝玉在一个多月的时间里，第一次允许马六甲号上的人登上金河号甲板，两艘船就停泊在爪洼岛西边的浅海区，以黄崖为首的所有马六甲号指挥管理层，包括水手长、领航员、大副、二副、书记官全都被绑在了金河号的船舷上，扒光了衣服执行鞭刑。
舰长黄崖知情不报是主犯，十五鞭！水手长和大副属于胁从，没尽到监督义务，每人十鞭！领航员和二副属于立场不坚定，没和错误做坚决斗争，每人五鞭！书记官和三名负责补给食物的一级水手每人三鞭，他们的罪名是没有严格检查上舰食物，造成疾病流行。这是重罪，如果不是因为那些东西都被扔进了海里，查无实据，他们几个这辈子恐怕就得去矿山上凿石头了。
“给我抽，一鞭子都不许少！死了我负责！”鞭子是用鲸鱼皮条编的，比大拇指还粗，两米多长，一鞭子下去就是一道子皮肉没了。自从发明这个刑罚之后，接受鞭刑的人没几个，不是犯了特别严重的错误，贾宝玉一般不会用这种处罚方式，就算慈禧兄弟倆对待奴隶也不经常使用，因为皮肉破裂之后容易感染，在这个没有抗生素的年代里，搞不好就会出人命的。但这次他真是急眼了，什么事情他都能忍、能自己开导自己大事化小，唯独疾病这件事儿他绝对忍不了。这玩意要是来了，它才不管你是不是穿越者、也不问你会多少知识、更不理睬你是不是首领，谁染上谁倒霉，绝对是大杀器！
贾宝玉觉得自己对这些船员和军官有点太仁慈了。让他们已经有点飘飘然，总觉得大不了就是灌两桶水，忍一忍就过去了，没什么大不了。这种思想要不得。海军不管在古代还是现代，都是要求纪律最严格的部队，因为任何一个人的小错误，就有可能让整船人全部完蛋，比什么军种都要命。
所以不光要抽满鞭数、还得当着两艘船全体船员抽。让这些平时得意洋洋的年轻军官扯着嗓子哭喊，看他们以后还有什么脸摇头晃脑。抽完了还不能算，从黄崖开始往下撸，全都降一级使用，还想升官？等着吧，被舰队降职就是一个人生污点，这是金河湾的大忌，别说舰队了，以后去了捕鲸船、商船都没啥好果子吃了。
但有的人是真哭，他们的孩子永远回不来了，二十三名水手死于疾病，五名水手死于意外，虽然说靠大海生活的人家早有这种心理准备，但那二十三个水手确实死得冤。他们本来是可以回来的，就因为当官的管理疏忽才造成了他们的死亡，而且还有十多个人身体一直没恢复过来，下船还得继续隔离观察，有家不能回。
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