在喵喵的呼喊下，小智带着自己的神奇宝贝们结束了早晨的训练，检验了一波早上大家的训练成果之后，回到了营地，叫醒了圣代，为她注入了一些常磐之力，增加了一些她的精力，待她更衣洗漱后，小智一行人也是彻底开始了早餐环节。
吃过早餐，小智收回了除皮卡丘、伊布、喵喵外的神奇宝贝们，与圣代以及三小只一起简单收拾了一波后，继续前进，走进了黑暗市这座萧条的城市。
“话说回来啊，喵~大白天在这里见不到人影，也太奇怪了，喵~”
继续前进，一个小男孩从房子里跑了出来，随后一名女子也跟着出来将小孩子拉了回去，还大声地说道：“不要跑到外面去呀。要是被神奇宝贝训练家看到了该怎么办啊？”
“诶？”听到这话的圣代率先疑惑道。
“看来是神奇宝贝训练家对这里居民做了什么不好的事情才导致的吧。”小智猜测道。
小智话音刚落，三块石子就朝着喵喵砸了过来，还好喵喵反应迅速勉强躲过一劫。
“到底是谁啊？喵~”喵喵愤怒地叫道。
小智在心中默念“波导之力存于吾心”开启了波导，接着将目光看向了石子的发射方向，屋顶的三个人影见此也立即趴了下去，试图躲过小智一行人的视线。
但他们三人不知道的是小智用波导之力已经知道了他们三人呆在原地，对待这种无缘无故伤害自家神奇宝贝的行为，小智可不会惯着。
于是小智向皮卡丘指明了一个方向，开口道：“皮卡丘，一百伏特把他们打下来。”
“皮卡，丘！”皮卡丘从小智的肩上来到了小智的帽子上，高高跳起，将三人打了下来，在小智一行人前方的草垫上一个压着一个地安全着陆。
“是小孩子耶，喵~”
“好痛啊。”三个小孩子一齐开口道。
小智走上前去，蹲在三个叠罗汉小孩子的身前说道：“不好意思，不过谁让你们用突然拿石头砸我们的。”
“就是啊，喵~”喵喵也在一旁附和道。
“你们是神奇宝贝训练家吧，对吧？”在最上方的蓝头发小孩开口道。
“啊？”小智站了起来，再一次开口道：“没错。我是小智，目前正在旅行。目标是成为世界第一的神奇宝贝大师。”
“我是小智的女朋友，我叫圣代。目前在跟着他一起进行着旅行。”
“我是喵喵啊，喵~目前担任小智的生活管家啊，喵~”
待小智一行人介绍完，三个小孩子就从草垫上站了起来，其中蓝头发的小男孩不知从哪拿出了一个木棍，准备向小智一行人进行打击。
拥有波导之力的小智自然是早有防备，直接用波导挡了下来，开口道：“一次不够还要来第二次？你们到底想干什么？”
“哼，不管怎么样，只要和神奇宝贝四个字搭上关系我们都很讨厌。谁让你们是神奇宝贝训练家呢？”蓝头发的小男孩带头说道。
“嗯嗯。”另外两个小孩则在一旁表示“俺也一样”。
“什么？神奇宝贝到底怎么你们了啊？”小智愤愤地回复道。
“你们别吵啦。”小智刚刚才说完话，远处就传来了声响，小智也被迫停止了输出。
过了一会儿，声音的传人就来到了小智一行人的面前，摸了摸蓝头发小孩的头，继续开口道：“不好意思，这几个孩子好像给你们添麻烦了。我得给你们好好配个礼，要不上我家坐坐？”
“诶？那就恭敬不如从命了。”见对方态度良好，小智也是牵着圣代，带着三小只跟着那位大叔来到了大叔的家中——黑暗市的一间餐厅内。
坐在餐厅的椅子上，大叔给小智一行人说了事情的来龙去脉，小智一行人隔壁的某位带着脸罩的人也听到了大叔说的话。
而事情的起因也很简单，就是这段时间黑暗市有两家道馆在争夺联盟道馆的道馆认证，每天都在打架，搞的黑暗市名不聊生的，因此这里的人们才会讨厌神奇宝贝，讨厌神奇宝贝训练家。
“看来那些家伙儿根本不懂神奇宝贝训练家意味着什么，这件事就交给我吧。”
“看来还是忍不住要出手了呀，小智。你的话，绝对能完美解决的。”经过这段时间小智的夜间输出，再结合小智珍惜时间天天给自己的神奇宝贝们进行训练来看，圣代觉得小智应对这种事情是完全没有问题的，所以她才信任小智道。
圣代的话刚刚说完，外面就开始嘈杂了起来。
“亚斯道馆的蠢货们，听好了，我们卡兹道馆注定会成为黑暗市唯一一家拥有黑暗徽章的道馆。”餐厅外，一名壮实的大叔放狠话道。
“卡兹道馆的渣渣们，都在胡扯什么呢？一个城市根本不需要两家道馆，黑暗市的正式道馆有我们亚斯道馆一家就够了。”瘦高的大叔回应道。
“今天一定会把你们揍得落花流水，满地找牙。”
“得了吧。应该是把你们打得片甲不回，寸草不留。”
“嗯？事到如今，你还在嘴硬。去吧，电击兽。”
“干掉他，飞天螳螂。”
“电击~”“恰~”
见老大派出了神奇宝贝，小弟们也紧随其后，亚斯道馆的小弟们派出了豪力、猴怪、艾比郎以及沙瓦郎；卡尔道馆的小弟们则是派出了拉达、巨钳蟹、隆隆岩、钻角犀兽（铁甲暴龙）。
目前双方正在处在对峙状态。
小智见双方还在对峙期，也是带着三小只，来到了这群人的中间，嚣张地说道：“看来就是你们在损坏神奇宝贝训练家的名声了。不长记性的家伙儿们，你们是注定成为不了道馆训练家的。”
“你说什么？”卡兹愤愤地说道。
“那就让你见识见识我们的厉害。大家，一起上。”亚斯指挥道。
“我们也上。”卡兹紧随其后。
听到自己老大的命令之后，小弟们也是跟着自家的老大朝小智靠近，他们的神奇宝贝也跟着飞天螳螂或者电击兽朝小智这边走来。
“皮卡丘，放电。喵喵，飞膝撞。”
“皮卡，丘！”皮卡丘走到小智的身前，使出了放电，将除了隆隆岩以外的神奇宝贝以及人类全部电倒在地。
“收到，喵~”喵喵也领会到了小智的意思，一发飞膝踢结果了隆隆岩，让他躺在地上，烧起了蚊香。
“看来你们也不过如此嘛，手下败将。以后就友好相处还黑暗市一份安宁吧。”
“说什么鬼话？准备好受死吧。”两位大叔一听这话就不乐意了，从电击中站了起来，一人拿着一根木棍，准备对小智进行物理制裁。
正当小智打算使用波导之力来给他们尝尝苦头时，那名带着面罩的人类站了出来，说道：“快点住手。”
“什么？”
“你又是谁啊？”
全副武装的人类伸出自己的手，握着神奇宝贝球，自我介绍道：“我就是——神奇宝贝联盟派来的正义的鉴定员。”
“诶？”
“去吧，神奇宝贝球。”在两位大叔震惊的目光下，那个人派出了自己的神奇宝贝，随着神奇宝贝球的打开，白光一闪，一只粉红色的神奇宝贝带着护士帽出现在了众人的面前。
“luky~lucky~”
“是吉利蛋耶，喵~那么她是？”
“没错，我的真实身份。”话刚说完，她就脱掉自己的武装，露出了自己原本的装扮，继续自我介绍道：“就是乔伊。”
自我介绍完之后，乔伊小姐对二人教训道：“你们竟然把神奇宝贝们当做打架的工具。我是绝对不会同意让这样的道馆成为正式道馆的。”
两人得知了面前女子的身份，停止了嚣张跋扈，有些颓废地跪在地上相继开口道。
“不是吧。”
“能不能请您再给我们一次机会啊？”
“如果你们愿意洗心革面的话，也是可以的哦。”
“我们当然愿意啊。”
“应该怎么做，请您来指教我们吧。”
“我倒是觉得，有人比我更适合指点你们哦。”乔伊说完话，用手指了指小智道。
“诶？我吗？”
就在小智一脸懵逼之时，两位大叔就来到了小智的身前，跪坐着给小智磕了一下头，说道：“老师，还请您指点一二。”
“既然你们这么虔诚，那我就指点你们一下吧。记住，神奇宝贝是我们最好的朋友。我们一定要和他们和睦相处。”
“也就是说，神奇宝贝对战？”卡兹维持着跪坐的姿势询问道。
“神奇宝贝对战就是要堂堂正正竭尽全力地去战斗才行。”
“那堂堂正正地跟别人打架可以吗？”
“不可以。打架与神奇宝贝对战可不一样。在我们以神奇宝贝为伙伴的前提下，神奇宝贝对战是用来衡量自己与自己伙伴的训练成果的战斗，也是训练家与训练家之家的交流方式。这么说的话，你们应该能理解了吧？”
“原来是这样啊。这么说的话我就懂了，神奇宝贝对战并不是打架，而是训练家与训练家的交流方式啊。”
“我也有些领悟了呢，老师。”
“感谢您的指教。”
“好了好了，有收获就好。记得要把黑暗市里被你们毁坏的东西通通修好哦。下次见面的话，希望你们能成为一名合格的训练家。”
“遵命，老师。我们一定谨遵您的教诲。”二人再一次给小智磕了一个头，向小智表达了感谢之情。
谢过之后，二人也是立即起身，开始了修复工作。
见二人这幅样子，小智也是开口说道：“看来还是有药可救呢。这两个家伙。”
“皮卡丘~”“布伊布伊~”“是啊，喵~”三小只点了点头，按照顺序说道。
“对了，乔伊搜查官，下次见面的话，请和我进行一场神奇宝贝对战吧。”感叹完之后，小智找到了乔伊小姐开口道。
“没问题。下次见面就来对战吧。”乔伊小姐也是答应了小智的对战请求道。
餐厅里的圣代见小智把事情完美解决了，也是从餐厅里出来，来到了小智的身边，与乔伊小姐以及三小只当起了监工。
等到卡兹与亚斯以及他们的小弟完成了修复之后，三个小孩来到了小智的面前，向皮卡丘、喵喵索要了签名，皮卡丘、喵喵很痛快地满足了他们的愿望。而伊布则因为没有出手，所以没有得到签名权。小智也只好摸了摸伊布的头以示安慰。不得不说的是，这招对伊布效果拔群，没一会儿伊布就欢快了起来。
至此，黑暗市的风波就彻底结束了。小智也牵着圣代带着三小只离开了黑暗市，朝着下一座城市进发了。
PS：图鉴补录
“猴怪，猪猴神奇宝贝。属于格斗类型，出拳神速，步伐轻盈。猴怪平时个性温和，但一旦激怒就会一发不可收拾。”
“火爆猴，猴怪的进化形。随时都在生气。一旦被它盯上，到死都会被它缠住。火爆猴的最擅长的绝招是大闹一番，一旦大闹一番起来就会引起大混乱。”
“多边兽，又名3D龙，虚拟神奇宝贝。是使用最先进的科学技术，并最终成功制造出人工的神奇宝贝。”
“迷唇姐，人形寶可夢。是少見的超能力寶可夢。擅長的絕招是使對方睡著的惡魔之吻。”
“拉普拉斯，可以理解人语，有高度智慧的神奇宝贝。个性温和，不喜欢战斗。是喜欢在背上载人的神奇宝贝。”
“火伊布，火神奇宝贝。体内有着火袋，深吸气后会吐出１７００度的火焰。”
“雷伊布，雷神奇宝贝。伊布利用雷之石进化过来的。受到惊吓时全身的毛会竖立成针状，来威吓敌人。最擅长电属性的绝招。”
“水伊布，吐泡神奇宝贝。喜欢干净的水边，在水中可以让身体像溶水中一般消失。”
“电击兽，电击神奇宝贝。非常喜欢强大的电力，所以会经常出现在大型发电厂等地。”
“豪力，怪力神奇宝贝。有着不会疲劳的强韧肉体。因为肉体非常强韧，所以戴着力量限制腰带来控制力量。”
“沙瓦郎，踢腿神奇宝贝。腿能自由地伸缩，即使离得很远，也能把对手踢飞。”
“隆隆岩，重量級神奇宝贝。被硬得像岩石的堅硬外殼包圍著，一年一度蛻皮一次，體積會變大。”
“钻角犀兽，钻锥神奇宝贝。是独角犀牛的进化形。犀角大，攻击力也强大。”