十八岁的明晖成功的跟工藤新一和毛利兰以及铃木园子成为了好朋友。
在帝丹高中待了一段时间，他的空手道水平已经达到了跟小兰差不多的程度的时候。他就准备离开高中校园回到公安了，临走的时候跟工藤新一说了句话：“不想回小学的话，去游乐园的时候最好离黑衣人远点。”
虽然他提示了工藤新一，但是他也知道那个冲动的侦探是不会听话的。
继降谷零之后，公安又派了赤井明晖进入黑衣组织卧底，并且给了接头暗号，让他配合安室透，在组织里等待任务。
这天晚上放学，小兰提醒工藤新一别忘了明天去游乐园约会。因为新一答应了，只要小兰得到空手道大赛优胜的话，就带她去多罗碧加游乐园约会。
而这个时候的明晖也刚刚申请了进入黑衣组织去当卧底。因为他有自信，他曾经向初代怪盗基德学习过易容伪装和变声技巧。他在黑羽盗一那里认识了有希子和贝尔摩德。但是当时的他并没有把自己表现的太过于天才，所以他在有希子和贝尔摩德眼里只是一个平平无奇的小师弟。甚至她们并没有太重视他的存在。
第二天工藤新一带着小兰去了游乐园。明晖每天都会对于自己会的空手道，在警校学的柔道以及枪法，自己哥哥赤井秀一教的截拳道进行很认真的练习。
工藤新一已经是平成年代的福尔摩斯，他的名气不小。当然其实他身上的死神体质也是真的没办法用科学来解释。
工藤新一跟小兰一起去玩过山车的时候发生了命案，他立刻让小兰打电话报了警。目暮警官迅速赶到了案发现场。
在名侦探一番推理之后，终于抓到了杀人凶手。可是谁都没有注意到，当听到他就是工藤新一时，他身后那两个黑衣人的反应。以及一直在暗中观察着他的赤井明晖，盯着工藤新一的身影摇了摇头。
在破完案子之后，新一就跟着小兰一起离开了。他突然间发现了刚刚一起坐过山车的两个黑衣人鬼鬼祟祟的从他面前走过。
一下子引起了一个侦探那该死的好奇心，他跟小兰说一声就上去偷偷跟着那两个黑衣人了。他躲在墙边偷看到了黑衣人的交易，在没有警惕背后的情况下被敲了一棒子，然后被黑衣人灌下了随身带着的药。
这一切赤井明晖都看在眼里，也录下来了。可是他这个时候没有办法出去帮忙。他知道那两个黑衣人就是琴酒和伏特加。
思来想去的明晖还是决定三思而后行。等琴酒和伏特加走了以后，他把已经变小的工藤新一送到了工藤家宅子隔壁的阿笠博士家，并跟阿笠博士说了他变小的事。
“唉，就知道一定是这样，如果他会听劝的话也就不是工藤新一了。”赤井明晖默默想着。
他现在要想的是怎么进入组织里，他并不是奔着当卧底去的，而是为了保护宫野志保和宫野明美姐妹。他知道这两姐妹的结局不怎么好，而且宫野明美本来应该是自己大哥赤井秀一的爱人，却由于大哥卧底身份被发现受到了牵连。既然这次自己知道这个世界的所有发生过的事，那么自己一定要努力去改变一些悲伤的结果。
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